在交大讀書和任教 嶄露頭角 　　1960年朱章玉直升交通大學工程力學系學習，在延長路校區（基礎部）讀一年級時繼續擔任學生會主席。二年級時到崇明圍墾灘涂，1961年參加中國共產黨。1962年工程力學系停辦，部分學生轉入自動控制系。時值吳健中老師籌建陀螺及導航儀器專業，朱章玉被吳看中調入門下成為吳老師的弟子。從此開始，先是吳老師的學生，畢業以后又是吳老師的助教、系科研秘書，他是吳先生親自挑選重點培養的5名學生之一，接受吳先生的“因材施教”，得到直接的關懷和指導。和吳老師共事幾十年，深受吳老師高尚品格和治學精神的影響，他視吳老師為“楷模和恩師”。大學期間，他一直擔任學生會副主席，協助主席龍樂豪（現中國工程院院士），在學生工作中付出很多，但也得到了全面的鍛煉。 　　1964年至1965年4月，參加奉賢“四清工作”半年。接著回校做了三個月的畢業設計。1965年7月畢業留校任教，不久便從交大附屬工廠調回教研組參加靜電陀螺研制，從事“核心敏感元件薄殼圓球的加工”。這是一項十分精密的技術，他和馬錫才師傅通力合作，終于做出了中國第一個乒乓球大小的空心薄殼園球，提供進行原理實驗。這項靜電陀螺研究瞄準美國50年代的研究水平，引起了學校和上海市領導的高度重視。常州航海儀器廠韓平廠長聞訊趕來學校要求承擔這個項目的產品開發，吳健中老師支持了這一廠校合作。靜電陀螺研制起步不久，轟轟烈烈的文化大革命運動開始了，停止所有的工作，交大所有設備封存運往常州工廠。 　　1967年9月，靜電陀螺研制項目重新啟動。在吳健中老師帶領下，朱章玉等10多人來到常州航海儀器廠，和清華等單位的研究人員住在水泵房改作的宿舍，冒著造反派武斗的危險，過著簡單的生活，大家感到遠離學校這個文革是非之地，又投入了科學研究工作，十分高興。4個單位的同志融為一體，團結合作，很快制定了一個既符合實際又優化的研究試驗計劃，分頭攻關。僅在半年內就解決了原理試驗中的關鍵——超高真空中電擊穿支撐實驗。朱章玉的妻子交大畢業后分配在常州航海儀器廠當技術員，也參加這項研究，兩人以廠為家，廢寢忘食全身心地投人研制工作。1968年兒子出生，兩個月就斷奶送回上海撫養。兒子8歲才接回常州。六機部和國防科委大力支持這項研制工作，經過大家幾年的努力，常州航海儀器廠成了江蘇省第一、全國少有的超高清潔度、高精度加工和陀螺飄移測試基地。這一靜電陀螺研制課題在兩三年內走完了美國早期約15年走過的路程。文化大革命達10年之久，朱章玉都在常州為靜電陀螺攻關，把整個青春獻給了研制靜電陀螺，他曾經在一周內到天津、北京、武漢、蘭州等地辦事，跑了十幾個省市，白天聯系工作，晚上大多是在火車上度過。有一次做陀螺漂移精度測試實驗，三天三夜（連續72小時）沒有休息。他這樣忘我工作，為我國國防科技事業作出過重要貢獻。 開創生物醫學工程學科 勇往直前 　　交通大學自1896年創建以來，沒有設置過生命和醫學學科，教育界和科學技術界也很少有人會把交通大學與這兩個領域聯系起來。1978年上海交大教授代表團首次訪問美國，打開了交大人的視野，為朱章玉闖入這些領域并成為學科帶頭人提供了機會。 　　1978年10月，以黨委書記鄧旭初為團長的交大教授代表團凱旋而歸，帶回美國大學中興起發展生命學科的重要信息，預見到“21世紀是生命科學的世紀”，提出了交大追趕世界科學發展前沿，發展生命科學的思路。在這前后，上海第一醫學院院長石美鑫與鄧旭初多次商討并提議聯合發展生物醫學工程學科，認為生命科學和醫學與工程技術科學結合有光明的發展前途。兩校取得了共識，很快，學校在調整和改造精密儀器和水聲專業的基礎上，選派骨干教師高忠華、朱章玉、黃奕昌等人負責籌建生物醫學工程專業，與上海第一醫學院基礎部共同培養研究生，開展學科建設。1979年初，上海交大生物醫學工程與儀器專業成立，這是交大歷史上第一個與生命科學相關的專業。同年7月招生，學制為5年。生物醫學基礎課程及全部實驗在第一醫學院完成。 　　朱章玉作為這個專業的副主任，積極聯系、爭取了國家醫藥管理總局的支持和歸口，并經過充分論證，用國家醫藥管理局撥款的150萬元，訂購了當時世界上先進、國內沒有的ATAC——450多道生理信號處理系統及超聲、電子等醫學工程實驗設備。后來又用范緒箕校長支持的世界銀行貸款，買進了一臺全新的醫學圖像處理裝置，建立起國內少有的先進的生物醫學工程實驗室。接著，師生們團結一致，利用先進的試驗設備，很快開展了高水平的科學研究，并和國外學者進行學術交流。朱章玉在校領導的指導下，考察、聯系、引進了幾位高水平專業教師，為他們解決工作和生活條件。特別是3次往返哈軍工，將著名的聲學專家王鴻樟教授調來學校，還力薦王先生擔任教研室主任，自己仍當副主任，積極協助他工作。正是由于王鴻樟領銜，交大早在1990年就獲得了生物醫學工程博士點。多年來許多教授已做出了世界一流水平的研究，如陳亞珠院士負責的超聲治癌和莊天戈、朱貽盛教授等人從事的生物醫學信息和圖像處理都形成了交大的特色和優勢，并保持至今。